Suodatetut pipetin kärjet niillä on kriittinen rooli monilla kokeellisilla aloilla, kuten modernissa biologiassa, kemiassa ja lääketieteessä. Sen huokoskoon valinta liittyy suoraan koenäytteiden laatuun, koetulosten tarkkuuteen ja kokeiden toistettavuuteen.
Ensinnäkin huokoskoon koko vaikuttaa näytteen epäpuhtauksien suodatusvaikutukseen. Jos huokoskoko on liian suuri, pieniä epäpuhtaushiukkasia, kuten solujäämiä, pölyhiukkasia tai liukenemattomia aineita, saattaa päästä näytteeseen pipetoinnin aikana. Nämä epäpuhtaudet voivat häiritä kokeellista reaktiota. Esimerkiksi soluviljelykokeissa epäpuhtaudet voivat tarttua solun pintaan, vaikuttaa solujen normaaliin kasvuun ja aineenvaihduntaan sekä aiheuttaa poikkeamia koetuloksista. Päinvastoin, jos huokoskoko on liian pieni, vaikka se voi siepata epäpuhtauksia tehokkaammin, se voi adsorboida näytteen kohdekomponentteja, erityisesti joitain makromolekyylejä, kuten proteiineja, nukleiinihappoja jne. Tämä johtaa näytteen konsentraatio ja tehdä myös koetuloksista epätarkkoja.
Erityyppisille koenäytteille sopiva huokoskoko on myös erilainen. Solususpensioita käsiteltäessä on yleensä tarpeen valita huokoskoko, joka voi tehokkaasti suodattaa solujätteet vahingoittamatta soluja. Yleisesti ottaen huokoskokoa 0,2 - 0,45 mikronia käytetään yleisemmin. Tämä huokoskokoalue voi estää useimmat epäpuhtaudet, kuten solujätteet ja bakteerit, varmistaen solujen puhtauden ja aktiivisuuden pipetoinnin aikana. Suodattimen huokoskoon valinnassa tulisi olla varovaisempaa nukleiinihappouuttokokeita suoritettaessa genomisen DNA:n rikkoutumisen välttämiseksi ja RNA:n eheyden varmistamiseksi. Yleensä valitaan noin 0,2 mikronin huokoskoko, joka ei ainoastaan poista mahdollisia epäpuhtauksia, vaan myös minimoi nukleiinihappomolekyyleihin kohdistuvan leikkausvoiman.
Lisäksi suodattimen huokoskoko vaikuttaa myös pipetoinnin tarkkuuteen ja sujuvuuteen. Liian pieni huokoskoko voi lisätä nesteen vastusta sen kulkeutuessaan läpi, mikä johtaa hitaampaan pipetointinopeuteen ja jopa nestemäisiin jäämiin. Tämä ei ainoastaan vähennä kokeen tehokkuutta, vaan voi myös vaikuttaa koetuloksiin epätarkan pipetointitilavuuden vuoksi. Sopiva suodattimen huokoskoko voi varmistaa, että neste kulkee sujuvasti pipetin kärjen läpi pipetoinnin aikana, mikä parantaa pipetoinnin tarkkuutta ja toistettavuutta.